Niisutavate ainete struktuuriomadused hõlmavad peamiselt nende molekulaarseid struktuurilisi omadusi ja keemilist koostist.
Niisutavate ainete molekulaarstruktuuri põhikarakteristik on see, et molekuli ühel otsal on hüdrofiilne rühm (segment) ja teisel otsal on hüdrofoobne rühm (segment). See struktuur võimaldab niisutavat ainet moodustada võileivakonstruktsiooni vedeliku ja tahke pinna vahel, vähendades sellega pindpinevust ja soodustades niisutamist. Täpsemalt, hüdrofiilsed rühmad (näiteks hüdroksüül, karboksüül jne) vastavad veega, samal ajal kui hüdrofoobsed rühmad (näiteks alküül, arüül jne) adsorbeeritakse tahkel pinnal, moodustades ühekihi, vähendades katte pindpinevust ja hõlbustades vedeliku levikut tahke pinnale.
Erinevate keemiliste struktuuride kohaselt saab niisutavaid aineid jagada järgmistesse kategooriatesse: orgaaniline räni tüüp: näiteks polüeetri modifitseeritud orgaaniline räni, mida kasutatakse peamiselt dünaamilise pindpinevuse vähendamiseks. Anioniline tüüp: näiteks etüleenoksiidi aduktid, mida kasutatakse peamiselt veepõhistes vaigusüsteemides. Nonioniline tüüp: näiteks fluori polümeerid, hea pinna aktiivsusega. Lisaks sellele tuleb praktilistes rakendustes kaaluda ka niisutavate ainete võimet vähendada pinna dünaamilist pinda. Näiteks vähendavad fluorit sisaldavad niisutajad peamiselt staatilist pindpinevust, samas kui silikoonist niisutajad võivad tõhusalt vähendada dünaamilist pindpinevust. Seetõttu on niisutava aine valimisel vaja konkreetse olukorra põhjal valiku teha.